Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms