Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc8P09025 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms