Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngr1O55100 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms