Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kif1cO35071 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms