Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms