Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8356J3QPD3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm8356J3QPD3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gm8356J3QPD3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm8356J3QPD3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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