Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms