Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vmn1r34G3XA52 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r34G3XA52 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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