Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim15G3UY57 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim15G3UY57 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms