Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp72F8VQC1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms