Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp9yF8VPU6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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