Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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H2-M1F7CXU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M1F7CXU4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2-M1F7CXU4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2-M1F7CXU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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