Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930579F01RikE9Q3L6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms