Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Susd1E9Q3H4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Susd1E9Q3H4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Susd1E9Q3H4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms