Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms