Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20425E9Q035 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20425E9Q035 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms