Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Vpreb3D3Z6J4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms