Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30cD3YVI9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms