Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trgv2A2J008 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trgv2A2J008 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms