Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEB3A0JP26 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEB3A0JP26 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms