Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-BlV9GXR0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-BlV9GXR0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-BlV9GXR0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-BlV9GXR0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-BlV9GXR0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-BlV9GXR0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-BlV9GXR0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms