Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc8a3S4R2P9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc8a3S4R2P9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc8a3S4R2P9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc8a3S4R2P9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc8a3S4R2P9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc8a3S4R2P9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms