Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl40Q9Z2Q5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl40Q9Z2Q5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl40Q9Z2Q5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms