Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Robo3Q9Z2I4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo3Q9Z2I4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Robo3Q9Z2I4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Robo3Q9Z2I4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Robo3Q9Z2I4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Robo3Q9Z2I4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms