Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Mbd3Q9Z2D8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mbd3Q9Z2D8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mbd3Q9Z2D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mbd3Q9Z2D8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms