Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf394Q9Z1D9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf394Q9Z1D9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf394Q9Z1D9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf394Q9Z1D9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Znf394Q9Z1D9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms