Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1A9

Tbc1d8, TBC1 domain family member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d8Q9Z1A9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tbc1d8Q9Z1A9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tbc1d8Q9Z1A9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tbc1d8Q9Z1A9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms