Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ror1Q9Z139 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ror1Q9Z139 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ror1Q9Z139 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror1Q9Z139 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ror1Q9Z139 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ror1Q9Z139 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ror1Q9Z139 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ror1Q9Z139 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms