Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd97Q9Z0M6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd97Q9Z0M6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd97Q9Z0M6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cd97Q9Z0M6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd97Q9Z0M6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cd97Q9Z0M6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd97Q9Z0M6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms