Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cul1Q9WTX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul1Q9WTX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul1Q9WTX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul1Q9WTX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cul1Q9WTX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul1Q9WTX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms