Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sorbs3Q9R1Z8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sorbs3Q9R1Z8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms