Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sae1Q9R1T2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sae1Q9R1T2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sae1Q9R1T2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sae1Q9R1T2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sae1Q9R1T2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms