Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rfwd2Q9R1A8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rfwd2Q9R1A8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfwd2Q9R1A8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfwd2Q9R1A8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfwd2Q9R1A8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms