Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc26a4Q9R155 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc26a4Q9R155 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc26a4Q9R155 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc26a4Q9R155 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc26a4Q9R155 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc26a4Q9R155 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms