Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hacd1Q9QY80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hacd1Q9QY80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hacd1Q9QY80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hacd1Q9QY80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms