Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reg3dQ9QUS9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reg3dQ9QUS9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Reg3dQ9QUS9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms