Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr4Q9QUK6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr4Q9QUK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlr4Q9QUK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlr4Q9QUK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr4Q9QUK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr4Q9QUK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms