Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmub1Q9JMG3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmub1Q9JMG3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmub1Q9JMG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmub1Q9JMG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmub1Q9JMG3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmub1Q9JMG3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms