Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms