Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SigirrQ9JLZ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SigirrQ9JLZ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SigirrQ9JLZ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SigirrQ9JLZ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SigirrQ9JLZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms