Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1aQ9JLR9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Higd1aQ9JLR9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Higd1aQ9JLR9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1aQ9JLR9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms