Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hmgn5Q9JL35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgn5Q9JL35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmgn5Q9JL35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hmgn5Q9JL35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmgn5Q9JL35 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms