Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Msgn1Q9JK54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Msgn1Q9JK54 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Msgn1Q9JK54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Msgn1Q9JK54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Msgn1Q9JK54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Msgn1Q9JK54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms