Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx20Q9JJY4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx20Q9JJY4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx20Q9JJY4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx20Q9JJY4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx20Q9JJY4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx20Q9JJY4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx20Q9JJY4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx20Q9JJY4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx20Q9JJY4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx20Q9JJY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx20Q9JJY4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx20Q9JJY4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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