Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfhx4Q9JJN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfhx4Q9JJN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfhx4Q9JJN2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfhx4Q9JJN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms