Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup50Q9JIH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup50Q9JIH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup50Q9JIH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup50Q9JIH2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup50Q9JIH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup50Q9JIH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup50Q9JIH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup50Q9JIH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup50Q9JIH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup50Q9JIH2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup50Q9JIH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup50Q9JIH2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms