Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn2Q9JI91 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn2Q9JI91 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn2Q9JI91 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn2Q9JI91 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn2Q9JI91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn2Q9JI91 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn2Q9JI91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn2Q9JI91 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn2Q9JI91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn2Q9JI91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms