Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp19Q9JHI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp19Q9JHI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp19Q9JHI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp19Q9JHI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp19Q9JHI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp19Q9JHI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms