Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf3Q9ET30 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm9sf3Q9ET30 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm9sf3Q9ET30 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm9sf3Q9ET30 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf3Q9ET30 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm9sf3Q9ET30 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf3Q9ET30 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms