Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dkc1Q9ESX5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dkc1Q9ESX5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dkc1Q9ESX5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dkc1Q9ESX5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dkc1Q9ESX5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dkc1Q9ESX5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dkc1Q9ESX5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms